RICERCA E SVILUPPO DI FARMACI BIOLOGICI E PICCOLE MOLECOLE E ASPETTI OMICI DELLA PROGETTAZIONE RAZIONALE DI FARMACIModulo ASPETTI OMICI DELLA PROGETTAZIONE RAZIONALE DEI FARMACI
Anno accademico 2022/2023 - Docente: SIMONE RONSISVALLERisultati di apprendimento attesi
Gli studenti dovranno apprendere quali sono le esigenze scientifiche che hanno portato alla nascita delle scienze "omiche", i campi scientifici di base che hanno sentito l'esigenza di una applicazione delle scienze "omiche" e in cosa esse differiscano o che informazioni aggiuntive diano rispetto alle tecniche classiche. Inoltre verranno trattate genomica, trascrittomica, epigenomica, proteomica e metabolomica con cenni riferiti alle tecniche classiche cosi' che lo studente possa richiamare gli studi effettuati su queste gia' apprese durante il suo corso di studi e usarle come termine di paragone per alla controparte "omica". Verranno valutati alcuni campi di applicazione. Inoltre verranno apprese le basi tecnologiche attraverso le quali queste scienze possano aiutare a progettare o riposizionare razionalemnte nuovi farmaci. Per questo verranno tarttati cenni di Spettrometria di massa (strumentazione e teoria) e di Modellistica Molecolare (con cenni di bioinformatica). Infine lo studente potra' lavorare su vere applicazioni in ambito patologico e approfondire le sue conoscenze tramite studio di casi.
Modalità di svolgimento dell'insegnamento
Lezioni frontali.
Qualora l'insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto dichiarato in precedenza, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel syllabus.
Prerequisiti richiesti
Genoma, geni, DNA, tutti i tipi di RNA e funzioni, modificazioni epigenetiche, epigenetica, proteoma e proteine, metaboliti
Frequenza lezioni
Obbligatoria
Contenuti del corso
Introduzione agli aspetti omici della scienza in ambito biologico
Tecniche scientifiche per la progettazione di farmaci: Strumentazioni e teoria di base (tecniche elettroforetiche, cromatografiche e Spettrometria di massa); Modellistica Molecolare basi teoriche (cenni di Bioinformatica)
Trattazione di: - Genomica(basi teoriche, sequenziamento, sviluppo delle tecnologia, analisi del genoma, sequenziamento "Shotgun", sequenziamento in "high-throughput, ricombinazione di sequenza e approcci, databases), trascrittomica (Isolamento dell'RNA, espressione di sequenza, analisi "serial and cap" dell'espressione genica, Microarrays, RNA-Seq), epigenomica (metilazione DNA, modificazione istonica, Chip-Chip e Chip-Seq, approcci "wide" e "non-wide", test di accessibilita' cromatoinica, individuazione diretta), proteomica (individuazione proteica con o senza anticorpi, tecnologie ibride) e matbolomica (metodi di separazione, metodi di detezzione, metodi statistici)
Campi di applicazione: Genomica (genomica funzionale e strutturale, sistemi modello), trascrittomica (diagnostica, trascrittomica umano-apatologica, stress ambientale, funzionamento genico, aging), epigenomica, proteomica (interazione proteomica e network proteico, espressione proteica, biomarcatori, proteogenomica, identificazione proteica, analisi della struttura proteica, analisi delle modifiche post-traslazionali) e metabolomica
Applicazioni in ambito patologico e Studio di casi
Testi di riferimento
Programmazione del corso
Argomenti | Riferimenti testi | |
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1 | Tutti gli argomenti trattati | Omics approaches, Technologies and application. Arivaradarajan P., Misra G., Springer 2018 |
Verifica dell'apprendimento
Modalità di verifica dell'apprendimento
L'esame Scritto mira a valutare il raggiungimento degli obbiettivi didattici.
La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica, qualora le condizioni lo dovessero richiedere.
Informazioni per studenti con disabilità e/o DSA
A garanzia di pari opportunità e nel rispetto delle leggi vigenti, gli studenti interessati possono chiedere un colloquio personale in modo da programmare eventuali misure compensative e/o dispensative, in base agli obiettivi didattici ed alle specifiche esigenze. E' possibile rivolgersi anche al referente CInAP (Centro per l’integrazione Attiva e Partecipata - Servizi per le Disabilità e/o i DSA) del Dipartimento di Scienze Biomediche e Biotecnologiche.