Innovative Biotechnologies: theoretical and practical approaches to genome-wide diagnostic

Il corso proporrà i principi teorico-pratici per l’utilizzo di tecniche di analisi dei genomi. Prevederà inoltre l’accesso al BRIT per assistere a dimostrazioni di utilizzo delle attrezzature.
1) Applicazioni delle biotecnologie comuni in emergenza:
La pandemia COVID
- qRT-PCR
- ddPCR
- Sanger
- NGS
Errori e limiti iniziali, improvement tecnologico: Analisi di alcuni paper Sequencing da Cadaveri, tool Bioinformatici (creati ad hoc) e NGS in alcuni case report.
2) NGS opportunità e Limiti:
- Tecnologie
- Strumentazioni
- Applicazioni
- NGS in tumori solidi
- NGS in campioni altamente degradati Coverage Geografico e di profondità di lettura: analisi di paper MGS score, Geografic SNPs Coverage diluition.
Whole o Target:
- Vantaggi e svantaggi
- Solidità del dato
Amplicon mRNA seq: RPKM vs qRT
3) Nuove Frontiere nella biotecnologia:
- Applicazioni dielettriche nella caratterizzazione cellulare
- Utilizzo di NCPs