MICROBIOLOGIA MOLECOLARE E MICROBIOLOGIA CLINICA
Modulo MICROBIOLOGIA MOLECOLARE APPLICATA ALLA MEDICINA

Anno accademico 2025/2026 - Docente: VIVIANA CAFISO

Risultati di apprendimento attesi

Il corso fornisce competenze avanzate in microbiologia e biologia molecolare dei microrganismi. Il corso approfondisce la filogenesi, l’identificazione e il typing dei microrganismi; i meccanismi molecolari di interazione ospite-microrganismo, patogenicità e virulenza; l’azione e la resistenza agli antibiotici, con focus sulla diagnosi e lo studio della resistenza antimicrobica. Gli studenti apprenderanno tecnologie molecolari per identificare patogeni e valutarne la resistenza agli antibiotici, tra cui PCR, sequenziamento genomico e real-time qPCR.

Contenuti del corso

1. Tassonomia e identificazione microbica fenotipica e molecolare. Esercitazione e Laboratorio.

2. Analisi e struttura di genomi di microrganismi Gram-positivi e Gram-negativi di interesse medico, struttura molecolare di locus genici di interesse biologico ed applicazioni di interesse diagnostico. Esercitazione e Laboratorio.

3. I Genomi microbici: Typing, filogenesi ed epidemiologia genomica. Applicazioni in biotecnologia medica. Esercitazione e laboratorio.

4. Meccanismi molecolari dell’interazione ospite-parassita: virulomi, loci regolatori di quorum sensing, produzione di biofilm, isole di patogenicità, CRISPR-Cas come sistemi di immunità adattativa. Applicazioni in biotecnologia medica. Esercitazione e Laboratorio.

5. Modelli in-vitro ed in-vivo per la validazione di target di virulenza. Applicazioni in biotecnologia medica. Esercitazione e Laboratorio.

6. Antimicrobici e loro bersagli molecolari.

7. Meccanismi molecolari di antibiotico-resistenza (AMR): resistomi, SNPomics, mobile genetic elements (MGEs), adaptive AMR. Applicazioni in biotecnologia medica. Esercitazione e laboratorio.

8. Meccanismi molecolari di adattamento microbico agli stress: indicatori di performance di crescita microbica, competitività, virulenza, fitness e fitness cost, sistemi Toxin/Antitoxin. Applicazioni in biotecnologia medica. Esercitazione e Laboratorio.

9. Tecnologie molecolari per la scoperta di target molecolari di virulenza, antibiotico-resistenza o fenotipi di interesse mediante PCR, real-time qPCR, Sanger sequencing e Next generation Sequencing microbico (seconda e terza generazione). Applicazioni in biotecnologia medica. Esercitazione e Laboratorio.

10. Metodiche molecolari per lo studio e la ricerca di biomarcatori funzionali di fenotipi di interesse mediante trascrittomica e analisi di trascritti mediante real time qRT-PCR e digital PCR e proteomica mediante analisi di spettrometria di massa ed analisi di proteine. Applicazioni in biotecnologia medica. Esercitazione e Laboratorio.

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